David

Guten Morgen, Zur Info, es scheint wieder Pipeline-Probleme im Nachtlauf (Sequenzen, ~21:30) zu geben. Der letzte Commit mit "SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.csv.xz", "SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz" (plus zugehöriger ".zenodo.json") war am 30. August. Viele Grüße, David...

Pipeline scheint wieder zu hängen

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Hi, zwar gab es heute ein zenodo-Update, aber das letzte FASTA/Sample-CSV-Update war am Mittwoch abend (2022-10-18) und das der Entwicklungslinien am Freitag morgen (2022-10-14). Viele Grüße David P.S. Gestern abend...

Upload to GISAID?

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Hi, it looks like the upload to GISAID is broken since the pipeline/dataformat change (last upload on 2019-09-19). Or is that intended? See also [Discussion on Twitter/X](https://x.com/Mike_Honey_/status/1849197334825165087?t=dSNAn8Ivq4VFsqTxurahvQ&s=19)  Best Regards...

Doublette Data and Removed Sequences in Update 2025-12-03

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Hi, In both the TSV metadata and the FASTA sequence data file are several doublette entries with same version(0) and igs_id (see below): * IMS-10004-CVDP-9689C968-C4BB-4753-AFC5-057F9E9B02E1 * IMS-10004-CVDP-C92FB2F2-114B-40C2-A9BD-2E3C4BB96EF2 * IMS-10013-CVDP-3AFB40A4-5F7B-4D94-A41D-67AD7F1167E2 *...