请问关于ORF预测结果中‘Psites_frame0_RPKM’代表什么意思？

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请问Psites_frame0_RPKM代表的位于0读码框架的reads计算的ORF的表达量吗，不包含读码框1和2的reads

Jun 08 '22 02:06 z626093820

是的，只使用了inframe reads （0位）计算的表达量

Jul 29 '22 01:07 zhengtaoxiao

假如我预测的是uorf,在结果文件里这个Psites_frame0_RPKM计算的是uorf inframe reads （0位）的表达量吗，而不是annotated orf的表达量。请问我的理解是正确的吗？我看结果的表格里也记录了annotated的位置和信息,谢谢您！！

Apr 26 '23 06:04 z626093820

假如我预测的是uorf,在结果文件里这个Psites_frame0_RPKM计算的是uorf inframe reads （0位）的表达量吗，而不是annotated orf的表达量。请问我的理解是正确的吗？我看结果的表格里也记录了annotated的位置和信息,谢谢您！！

您好，我也有同样的问题，您上述问题的答案是肯定的吗？

Jun 11 '23 08:06 Dazhuangafei

假如我预测的是uorf,在结果文件里这个Psites_frame0_RPKM计算的是uorf inframe reads （0位）的表达量吗，而不是annotated orf的表达量。请问我的理解是正确的吗？我看结果的表格里也记录了annotated的位置和信息,谢谢您！！

是的，你的理解是对的

Jul 19 '23 10:07 zhengtaoxiao