可以用ggarrange 组合多张gseaplot2 图吗？

[zhangzhanglan]

可以用ggarrange 组合多张gseaplot2 图吗？ 貌似不可以，gseaplot2是多图层无法返回plot。gseaplot[[1]] 也不行。

请问有什么方法，谢谢。

[zhangzhanglan]

已解决，取[[1]]部分，自己加上坐标轴。如果不需要坐标轴，直接 subplots = 1 返回也可以。

[Pancreatologist]

已解决，取[[1]]部分，自己加上坐标轴。如果不需要坐标轴，直接 subplots = 1 返回也可以。 你好，能分享一下出图代码吗？我也想把多个GSEA结果的同一通路的条形码图合并到一起，但有点没懂你说的。谢谢

[zhangzhanglan]

我主要是把生成的图存成一个二级列表plotlist，通过ggarrange排列多图。 但是gseaplot2实际是返回3个子图，无法赋值给plotlist。 有以下两种解决方法， 1是 p <- gseaplot2(kk, paths, subplots=1), 只取折线图，p就只返回一个子图，赋值给二级列表； 2是ggplot 重新自己画，参考 gseaplot.R 。

[GuangchuangYu]

组图用aplot是可以的。