createKEGGdb
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unused argument (species)
Error in clusterProfiler:::kegg_list(“pathway”, species): unused argument (species)
我首先安装工具包 通过R包remotes安装createKEGGdb工具: install.packages("remotes") remotes::install_github("YuLab-SMU/createKEGGdb", force = TRUE) createKEGGdb::create_kegg_db("hsa")
这个时候第一次会报错没有clusterProfiler,安装: BiocManager::install("clusterProfiler")
然后就会报这个错误:
是clusterProfiler新版不支持createKEGGdb了吗,有没有办法解决,谢谢。