[CICD] サーバには不要なmodは含めないようにする

[tier940]

Task

• 現状はクライアント、サーバ関係なくmodが導入された状態でパックが作成されるのを修正する。
• また可能であればLWJGL3用に分岐しているファイルもなくしたい(/buildtools/gen-lwjgl3-manifest.py)。